Автоматизированный тест жидкостной биопсии позволяет прогнозировать раннее прогрессирование заболевания и выживаемость пациентов с метастатическим раком молочной железы

Новый автоматизированный тест жидкой биопсии, разрабатываемый исследователями из Онкологического центра Киммела при Джоне Хопкинсе, может использоваться для прогнозирования раннего прогрессирования заболевания и потенциальной выживаемости среди пациентов с метастатический рак молочной железы всего через месяц после начала лечения, согласно недавнему исследованию.

Тест — пока прототип только для исследовательских целей — смог определить наличие раковой ДНК в одном или нескольких из девяти генов, которые обычно изменяются при раке молочной железы, в образцах крови женщин, активно проходящих лечение рака молочной железы. Метилирование — это тип химической метки, связанной с развитием и прогрессированием рака из-за его способности отключать гены-супрессоры опухолей. Пациенты с высоким кумулятивным метилированием на четвертой неделе лечения имели значительно более короткую выживаемость без прогрессирования (период времени, в течение которого заболевание не ухудшается) и худшую общую выживаемость, чем те, у кого было низкое кумулятивное метилирование.

Исследователи использовали уровни метилирования, измеренные на четвертой неделе, для разработки новой модели для прогнозирования риска раннего прогрессирования заболевания у женщин с метастатическим раком молочной железы. Результаты исследования опубликованы в журнале Клинические исследования рака.

Прогностические клинические биомаркеры для выявления раннего прогрессирования заболевания необходимы женщинам с метастатическим раком молочной железы, учитывая гетерогенность состояния, объясняет ведущий автор исследования Кала Вишванатан, доктор медицинских наук, директор Службы генетики и профилактики рака в Онкологическом центре Киммела при Джоне Хопкинсе. По ее словам, биомаркеры могут помочь онкологам свести к минимуму негативное влияние комбинаций лекарств на качество жизни пациентов за счет оптимизации использования доступных и эффективных методов лечения.

Выглядит многообещающе, что мы можем обнаружить метилирование в первые четыре недели лечения. В настоящее время мы ждем, пока не увидим симптоматических или клинических изменений, обычно в течение трех месяцев, прежде чем корректировать лечение. Если бы мы могли обнаруживать изменения раньше, мы могли бы корректировать лечение раньше, если это необходимо, с целью достижения лучших клинических результатов и продления выживаемости».

Кала Вишванатан, доктор медицинских наук, MHS, директор Службы генетики и профилактики рака, Онкологический центр Киммела при Джоне Хопкинсе

Анализ, названный жидкой биопсией для метилирования рака молочной железы (LBx-BCM), был разработан в лаборатории Сарасвати Сукумар, доктора философии, профессора онкологии в онкологическом центре и соавтора исследования. Анализ совместим с коммерчески доступной платформой молекулярного тестирования под названием GeneXpert и менее чем за пять часов может обнаружить метилирование в следующих генах, измененных в четырех подтипах рака молочной железы: AKR1B1, TM6SF1, ZNF671, TMEFF2, COL6A2, HIST1H3C, RASGRF2, HOXB4. и RASSF1. Текущее исследование также искало метилирование в гене ZNF671, связанное с рецептором эстрогена (ER)-отрицательным раком молочной железы. Анализ требует менее 15 минут практического времени лаборанта.

Исследователи оценили анализ с использованием образцов плазмы, собранных у 144 пациентов с метастатическим раком молочной железы до начала лечения, а также через четыре и восемь недель лечения. Средний возраст пациентов составлял 56 лет. Девятнадцать процентов были чернокожими, а 87% находились в постменопаузе. Среднее время наблюдения за группой составило около шести лет.

Медиана выживаемости без прогрессирования для пациентов с высоким кумулятивным метилированием на четвертой неделе составила 2,88 месяца по сравнению с 6,66 месяца для пациентов с низким метилированием. Медиана общей выживаемости для лиц с высоким кумулятивным метилированием на четвертой неделе составила 14,52 месяца по сравнению с 22,44 месяца для лиц с низким метилированием.

Исследователи также изучили связь между кумулятивным метилированием и статусом заболевания при первой повторной стадии рака примерно через три месяца. У 77% пациентов кумулятивный уровень метилирования снижался в течение первых четырех недель, а затем оставался стабильным до первой повторной постановки. У 18% пациентов со стабильным заболеванием и у 37% пациентов с прогрессирующим заболеванием наблюдалось увеличение кумулятивного метилирования от исходного уровня до четвертой недели. Дальнейшего увеличения кумулятивного метилирования среди тех, кто ответил на лечение, не наблюдалось, при этом уровни оставались стабильными с четвертой по восьмую неделю.

Высокое по сравнению с низким кумулятивное метилирование на четвертой неделе было связано с прогрессирующим заболеванием при первой повторной стадии. Связь между кумулятивным уровнем метилирования на четвертой неделе при первом повторном стадировании и прогрессирующим заболеванием оставалась значимой даже в присутствии других циркулирующих маркеров, используемых для мониторинга прогрессирования заболевания, таких как циркулирующие опухолевые клетки.

Исследователи использовали результаты кумулятивных уровней метилирования, измеренных на четвертой неделе, для разработки и оценки новой модели для прогнозирования прогрессирования заболевания уже через три месяца после начала лечения.

«Насколько нам известно, это первая модель прогнозирования на основе метилирования, ориентированная на раннее прогрессирование заболевания у пациентов с метастатическим раком молочной железы», — говорит Сукумар. «Модель оказалась надежной при проверке с использованием множества различных статистических предположений», — добавляет Лесли Коуп, доктор философии, доцент кафедры онкологии, специалист по биостатистике и второй соавтор исследования.

Следующими этапами исследования являются изучение паттернов метилирования, наблюдаемых каждую неделю после начала лечения, для определения оптимального времени для измерения кумулятивного метилирования, а также для проверки и уточнения модели в аналогичных популяциях пациентов, а также у пациентов с ранней стадией заболевания, Вишванатан. говорит.

Соавторами исследования были Мэри Джо Факлер, Майкл Консидайн, Лори Соколл, Кристофер Б. Умбрихт и Антонио К. Вольф из Университета Джона Хопкинса. Другие авторы были из Университета Северной Каролины в Чапел-Хилл; Seagen в Ботелле, штат Вашингтон; Клиника Мэйо в Рочестере, Миннесота; Институт рака Дана-Фарбер в Бостоне; Чикагский университет; Университет Индианы в Индианаполисе; и Цефеида из Саннивейла, Калифорния.

Работа была поддержана Министерством обороны (грант W81XWH-18-1-0018) и исследовательским соглашением от Cepheid (№ 90066820) с Sukumar, а также финансовой поддержкой Консорциума трансляционных исследований рака молочной железы (TBRCC) от Рака молочной железы. Исследовательский фонд и Сьюзен Г. Комен. Вишванатан, Коуп, Факлер, Вольф и Сукумар сообщили о грантах от Cepheid во время проведения исследования и имеют патенты. Университет Джонса Хопкинса регулирует эти отношения в соответствии со своей политикой в ​​отношении конфликта интересов.

https://www.hopkinsmedicine.org/”> Джонс Хопкинс