Горнодобывающая архея для антибиотиков | Nature Biotechnology

Большинство усилий по открытию антибиотиков сосредоточены на бактериях и грибах, оставляя область археи недостаточно. Археи эволюционно расходятся от бактерий и эукариот, что приводит к уникальным метаболическим путям и защитным механизмам, которые могут привести к структурно и функционально различным зашифрованным пептидам – короткие последовательности в более крупных белках, которые проявляют антимикробную активность. Написание в Природная микробиологияTorres et al. Теперь используйте искусственный интеллект, чтобы исследовать пространство последовательности археома для новых антимикробных соединений.

Авторы использовали обновленную версию Apex модели глубокого обучения на шахте 233 Archaeal Proteomes, идентифицируя 12 623 пептидных последовательностей с потенциальной антимикробной активностью, которую они называют архаинами. Последовательно наиболее разнообразные архаиины возникли из белков с разнообразными функциями и распределением. Их аминокислотный профиль отличался от известных антимикробных пептидов в базах данных.