Анзалон, А.В. и др. Редактирование генома с поиском и заменой без двухцепочечных разрывов или донорской ДНК. Природа 576149–157 (2019).
Лин, К. и др. Высокоэффективное первичное редактирование с использованием оптимизированных парных пегРНК в растениях. Нат. Биотехнология. 39923–927 (2021).
Чжуан Ю. и др. Повышение эффективности и точности первичного редактирования с помощью пар направляющих РНК. Нат. хим. Биол. 1829–37 (2022).
Ван Дж. и др. Эффективное целенаправленное встраивание крупных фрагментов ДНК без доноров ДНК. Нат. Методы 19331–340 (2022).
Чой Дж. и др. Точные геномные делеции с использованием парного простого редактирования. Нат. Биотехнология. 40218–226 (2022).
Цзян Т., Чжан С.-О., Венг З. и Сюэ В. Удаление и замена длинных геномных последовательностей с использованием простого редактирования. Нат. Биотехнология. 40227–234 (2022).
Чен, П.Дж. и Лю, Д.Р. Основное редактирование для точных и универсальных манипуляций с геномом. Нат. Преподобный Жене. 24161–177 (2023).
Лю, Б. и др. Редактор разделенных праймов с несвязанной обратной транскриптазой и матрицей кольцевой РНК. Нат. Биотехнология. 401388–1393 (2022).
Нельсон, JW и др. Сконструированные пегРНК повышают эффективность первичного редактирования. Нат. Биотехнология. 40402–410 (2022).
Лю, Ю. и др. Усиление первичного редактирования за счет Csy4-опосредованной обработки пегРНК. Сотовые Рез. 311134–1136 (2021).
Чжан Г. и др. Усиление первичного редактирования с помощью пегРНК, соединенной с мотивом xrRNA. Нат. Общий. 131856 (2022).
Ли, X. и др. Повышение эффективности первичного редактирования с помощью модифицированной пегРНК с G-квадруплексами РНК. Дж. Мол. Клетка. Биол. 14mjac022 (2022).
Фэн Ю. и др. Повышение эффективности и гибкости первичного редактирования с помощью привязанных и расщепленных пегРНК. Белковая клетка 14304–308 (2022).
Понниенсельван, К. и др. Уменьшение внутреннего аутоингибирующего взаимодействия внутри пегРНК повышает эффективность первичного редактирования. Нуклеиновые кислоты Рез. 516966–6980 (2023).
Эллефсон, JW и др. Синтетическое эволюционное происхождение корректурной обратной транскриптазы. Наука 3521590–1593 (2016).
Скаско М. и др. Механистические различия в РНК-зависимой полимеризации ДНК и точности между вирусом мышиного лейкоза и обратными транскриптазами ВИЧ-1. Ж. Биол. хим. 28012190–12200 (2005).
Мэтьюз, К.К. Метаболизм дезоксирибонуклеотидов, мутагенез и рак. Нат. Преподобный Рак 15528–539 (2015).
Ву, В.-Дж., Ян, В. и Цай, М.-Д. Как ДНК-полимеразы катализируют репликацию и репарацию с противоречивой точностью. Нат. Преподобный Хим. 10068 (2017).
Трунигер В., Лазаро Дж. М. и Салас М. Два положительно заряженных остатка ДНК-полимеразы phi29, консервативные в ДНК-полимеразах с белком, участвуют в стабилизации входящего нуклеотида. Дж. Мол. Биол. 335481–494 (2004).
Гальперин, С.О. и др. ДНК-полимеразы, управляемые CRISPR, позволяют диверсифицировать все нуклеотиды в настраиваемом окне. Природа 560248–252 (2018).
Тоу, СиДжей, Шаффер, Д.В. и Дубер, Дж.Э. Целевая диверсификация в С. cerevisiae геном с CRISPR-ориентированной ДНК-полимеразой I. АКС Синтез. Биол. 91911–1916 (2020).
Грюневальд Дж. и др. Разработаны прайм-редакторы CRISPR с компактными, несвязанными обратными транскриптазами. Нат. Биотехнология. 41337–343 (2022).
Оцубо Ю., Сасаки Х., Нагата Ю. и Цуда М. Оптимизация реакции включения одноцепочечной ДНК с помощью обратной транскриптазы вируса мышиного лейкоза Молони. ДНК Рез. 25477–487 (2018).
Петри, К. и др. Прайм-редактирование CRISPR с помощью рибонуклеопротеиновых комплексов в рыбках данио и первичных клетках человека. Нат. Биотехнология. 40189–193 (2022).
Ван, К. и др. Расширение охвата и исследование потенциала основных редакторов посредством доставки аденовирусных векторов с полностью удаленными вирусными генами. Нуклеиновые кислоты Рез. 4911986–12001 (2021).
Лю, П. и др. Улучшенные прайм-редакторы позволяют корректировать патогенные аллели и моделировать рак у взрослых мышей. Нат. Общий. 122121 (2021).
Эстебан Дж. А., Салас М. и Бланко Л. Верность ДНК-полимеразы phi 29. Сравнение инициации с белком и полимеризации ДНК. Ж. Биол. хим. 2682719–2726 (1993).
Либерман, К.Р. и др. Процессивная репликация отдельных молекул ДНК в нанопорах, катализируемая ДНК-полимеразой phi29. Варенье. хим. Соц. 13217961–17972 (2010).
Анзалон, А.В. и др. Программируемое удаление, замена, интеграция и инверсия больших последовательностей ДНК с редактированием двойных простых чисел. Нат. Биотехнология. 40731–740 (2021).
Бланко, Л. и др. Высокоэффективный синтез ДНК с помощью ДНК-полимеразы фага фи 29. Симметричный способ репликации ДНК. Ж. Биол. хим. 2648935–8940 (1989).
Гиллмор, JD и др. Редактирование генов CRISPR-Cas9 in vivo при транстиретиновом амилоидозе. Н. англ. Дж. Мед. 385493–502 (2021).
Ли, Р.Г. и др. Эффективность и безопасность исследовательской однокурсовой терапии CRISPR с редактированием оснований, нацеленной на PCSK9, на моделях приматов и мышей, не являющихся человеком. Тираж 147242–253 (2023).
Хопфнер, К.-П. И Хорнунг, В. Молекулярные механизмы и клеточные функции передачи сигналов cGAS-STING. Нат. Преподобный мол. Клеточная Биол. 21501–521 (2020).
Цзян Т. и др. Химические модификации мРНК-редактора адениновых оснований и направляющей РНК расширяют сферу его применения. Нат. Общий. 111979 (2020).
Чжэн С. и др. Гибкий редактор разделенных праймов, использующий усеченную обратную транскриптазу, улучшает доставку двойного AAV в печень мыши. Мол. Там. 301343–1351 (2022).
Мир А. и др. Сильно и полностью модифицированные РНК обеспечивают эффективное редактирование генома с помощью SpyCas9. Нат. Общий. 92641 (2018).
Лю, Б. и др. Направленное редактирование генома с помощью ДНК-зависимой ДНК-полимеразы и экзогенных ДНК-содержащих матриц. NCBI Биопроект https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/1004245 (2023).
2023-09-14 00:00:00
1694710225
#Направленное #редактирование #генома #помощью #ДНКзависимой #ДНКполимеразы #экзогенных #ДНКсодержащих #матриц
