Ранний выпуск – Вспышка тяжелой формы Streptococcus equi Subspecies zooepidemicus в результате употребления непастеризованных молочных продуктов, Италия – Том 29, номер 5 – май 2023 г. – журнал Emerging Infectious Diseases

В период с ноября 2021 г. по февраль 2022 г. С. равный подвид зооэпидемический инфекции были выявлены у 18 госпитализированных пациентов, проживавших на ограниченной территории в провинции Пескара, Италия (рис. 1). У больных наблюдался широкий спектр клинических проявлений, в том числе септицемия, фарингит, артрит, увеит, эндокардит. Пятеро из этих пациентов умерли от тяжелого менингита. В большинстве случаев С. равный подвид зооэпидемический бактериемия сопровождалась >1 дополнительный локализованный бактериальный очаг. С. равный подвид зооэпидемический был обнаружен в различных образцах пациентов, включая суставные выпоты и спинномозговую жидкость, которые были протестированы в больничных лабораториях. Целевая группа, состоящая из врачей, ветеринаров, эпидемиологов, ученых, микробиологов и специалистов по коммуникациям, была создана и координируется местным компетентным органом для оценки вспышки.

Мы провели активное расследование С. равный подвид зооэпидемический случаи, определяемые как пациенты с лабораторно подтвержденной инфекцией. Мы выявили 37 случаев вспышки за 7-месячный период. Мы провели интервью с 36 пациентами или их родственниками с помощью опросников по телефону. Пациенты были в возрасте от 6 до 98 лет (в среднем 79 лет). Мужчины (n = 16) и женщины (n = 21) были представлены одинаково (табл. 1). Мы получили 21 изолят бактерий от 19 госпитализированных пациентов, которые были отправлены в Istituto Zooprofilattico Sperimentale в Терамо, Италия. Мы идентифицировали виды бактерий с помощью времяпролетного масс-спектрометра с лазерной десорбцией/ионизацией на матрице Biotyper (Bruker,

Мы выполнили полногеномное секвенирование 21 изолята с использованием платформы Illumina (Illumina, с настройкой 300 циклов (считывания парных концов по 150 п.н.) (11). После проверки качества считывания мы подтвердили, что все клинические штаммы были С. равный подвид зооэпидемический с помощью инструмента KmerFinder (12). Мы присвоили поездам тип последовательности (ST) 61, используя схему мультилокусной типизации последовательности (13) (

Мы подтвердили корреляцию между человеческими штаммами, выполнив анализ однонуклеотидного полиморфизма (SNP) в Центре безопасности пищевых продуктов и прикладного питания Управления по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (14) и с использованием технологии MinION (15) для получения гибридного генома штамма вспышки в качестве эталона. Мы обнаружили, что все 21 клинический штамм были близкородственными (0–3 SNP), что предполагает участие уникального исходного штамма в наблюдаемых случаях у людей. Более того, тест на чувствительность к противомикробным препаратам, проведенный на всех человеческих штаммах, дал идентичные результаты, подтверждая гипотезу о том, что один исходный штамм был ответственен за все случаи заболевания человека.

Службы общественного здравоохранения, ветеринарии и пищевой гигиены провели обширное расследование для выявления источника инфекции. Эпидемиологический анализ показал, что 31 больной употреблял в пищу мягкие или полумягкие сыры, приобретенные у местных производителей или у дилеров. Всего было проверено 8 местных предприятий по производству молочных продуктов. Образцы сырого нерасфасованного молока (коровьего и овечьего), свежего сыра из непастеризованного и пастеризованного молока и воды были получены от каждого оператора и отправлены в Экспериментальный зоотехнический институт, Терамо, для обнаружения бактерий. Мы культивировали образцы и изолировали стрептококк виды из агара с овечьей кровью после инкубации в течение 24 ±1 ч при 37°С ±1°С в среде с 5% СО₂ обогащенная атмосфера. Мы протестировали все образцы с использованием наборов Genesig для ПЦР в реальном времени (Primerdesign Ltd, Primerdesign.co.uk). Мы провели идентификацию видов и секвенирование всего генома, как описано для образцов человека. Мы обнаружили С. равный подвид зооэпидемический в образце непастеризованного коровьего молока, взятого у 1 производителя молочной продукции, выбранного в районе вспышки. Затем этот оператор был официально проинспектирован и отобран местными компетентными органами; всего 18 С. равный подвид зооэпидемический штаммы были выделены из 2 резервуаров для наливного молока и 2 образцов сыра из сырого молока. Последовательности генома из этих образцов также были ST61; Анализ SNP показал, что 18 штаммов сгруппированы с клиническими штаммами, что указывает на сильную корреляцию между штаммами, полученными оператором и человеком.

После С. равный подвид зооэпидемический был идентифицирован как патоген, ответственный за случаи заболевания людей, мы рассмотрели данные из библиотеки штаммов Istituto Zooprofilattico Sperimentale. Мы обнаружили штамм, выделенный из молока коровы, больной маститом, в ноябре 2021 г.; животное принадлежало тому же оператору, продукты которого дали положительный результат. После секвенирования штамм также был идентифицирован как ST61 (таблица 2) и сгруппирован с другими штаммами, выделенными от пациентов-людей и продуктов из сырого молока (рис. 2).

На основании эпидемиологических и лабораторных анализов местными компетентными органами установлены меры по ограничению и предупреждению С. равный подвид зооэпидемический распространилась к концу февраля 2022 года. Вся молочная продукция была отозвана с рынка и у местных дилеров, созревающие сыры уничтожены, а местные власти потребовали пастеризации молока, предназначенного для производства сыра.

Мы сообщаем об эпидемиологических, микробиологических и геномных С. равный подвид зооэпидемический вспышка, в которой приняли участие 37 пациентов в Италии. Мы обнаружили сильную геномную корреляцию между штаммами, выделенными от больных, непастеризованным молоком и молочными продуктами, а также молоком от инфицированных коров, что четко указывало на источник зоонозной инфекции. Анкетирование и лабораторные данные показали, что заражение людей было вызвано употреблением в пищу непастеризованного свежего сыра, полученного от инфицированных дойных коров. Нам не удалось проследить происхождение инфекции от конкретного домашнего скота, занимающегося производством молочных продуктов. Фермер, у которого была положительная корова, сослался на строительные работы в коровнике в период с октября по ноябрь 2021 года, которые могли вызвать стресс, предрасполагающий животное к маститу. Возможна реактивация латентного С. равный подвид зооэпидемический инфицирование не исключено. Выявление источника инфекции за относительно короткое время позволило быстро отреагировать, что предотвратило дальнейшие случаи в сообществе. Однако вспышка в Италии считалась самой крупной и тяжелой вспышкой, связанной с потреблением непастеризованного свежего сыра, о которой сообщалось.

Таким образом, наше исследование подразумевает С. равный подвид зооэпидемический как возможный зоонозный патоген и подчеркивает вирулентность бактерии для человека. Осведомленность об индивидуальных анамнестических данных и, в частности, о возможных контактах с домашними животными или недавнем употреблении непастеризованных молочных продуктов имела решающее значение для борьбы с этой вспышкой. Не менее важным и чрезвычайно ценным был междисциплинарный подход «Единое здоровье», который использовался для поиска решений и решения проблем сообщества. Необходимы дальнейшие исследования, чтобы получить представление о патогенных характеристиках штамма, вызвавшего вспышку. Ранняя диагностика и идентификация бактерий с использованием молекулярных методов улучшит результаты лечения, позволит своевременно проводить эпидемиологический надзор за заболеваниями и предотвратит распространение опасных для жизни инфекций.