Сигнал Boost раскрывает сотни скрытых партнеров по связыванию для рецептора белка крови

Количество каждого из более чем тысячи различных гликопротеинов в вашей крови широко варьируется, с 10 наиболее распространенными гликопротеинами составляют 90% от общей массы. Поиск белка, которого нет в этой 10 -й 10, немного похоже на поиск Waldo, если только одно исполнение персонажа оставалось в коллекции каждого «где есть Waldo».

Этот диапазон неравенства в белок Концентрация называется динамический диапазони ученым затрудняет идентифицировать менее общепринятые белки и их соответствующие рецепторы.

Ученые из Sanford Burnham Prebys и коллеги из исследовательского института Scripps опубликовано выводы в Природная связь Демонстрируя стратегию идентификации менее природных белков, которые связываются со специфическим типом рецептора, называемой эндоцитарным лектином, а также MRC1 рецептора маннозы (также известный как CD206 и MMR). Этот подход позволил исследовательской группе раскрыть сотни связующих партнеров, которые вместе предсказывали роль MRC1 в нашем здоровье.

Чтобы повысить сигнал и преодолеть шум стольких белков, появляющихся на разных уровнях, исследователи использовали прототип, связывающий с маннозой лектин, конканавалин А (CONA), чтобы сначала обогатить их белки крови с несколькими связями с маннозой.

«CONA и MRC1 обладают одинаковыми свойствами связывания с маннозой, однако, MRC1 не доступен в качестве аналогичного активного рекомбинантного белка», – сказал Мэйанк Сарасват, доктор философии, старший сотрудник Sanford Burnham Prebys и соавторский автор исследования.

«Мы изолировали белки, которые связывают CONA из плазмы нормальных мышей и от мышей, лишенных MRC1», – сказал Сарасват. «Сравнения выявили повышенную чувствительность и селективность, позволяющую идентифицировать лиганды рецептора, когда они накапливаются в крови в отсутствие MRC1».

MRC1 сохраняет концентрацию различных критических белков плазмы крови в здоровом диапазоне. Это происходит путем связывания с белками, которые были посттрансломно модифицированы с маннозой, иногда называемыми маннозилированными белками. Связывание маннозилированных белков с MRC1 инициирует механизм эндоцитарного клиренса, который ограничивает полу -лиганд MRC1 и изобилие в кровообращении.

После сравнения белков в кровотоках нормальных мышей и мышей, лишенных MRC1, команда обнаружила накопление 244 маннозилированных белков плазмы крови вдвое или более количеств, обнаруженных у нормальных мышей из -за того, что MRC1 больше не контролирует уровни.

Затем ученые внимательно рассмотрели недавно идентифицированные лиганды. Они использовали биоинформатику для обзора и изображения этих сотен белков по их функциям.

«Мы заметили, что у многих белков играл очень важную роль», – сказал Джейми Март, доктор философии, профессор Sanford Burnham Prebys и старший автор рукописи, Джейми Март. «Ренин и ангиотензин-конвертирующие ферменты, например, являются основными регуляторами артериального давления».

Исследователи глубже вырываются в восьми из этих белков, которые, как известно, влияют на артериальное давление, воспаление, функцию органов и сепсис.

«Мы наблюдали нарушение нормальной физиологии и функции, которые были полностью предсказуемыми из идентичностей накапливающихся маннозилированных белков, с дополнительным эффектом отслеживания заболеваний с хронологическим возрастом», – сказал Март.

В случае сепсиса мыши, лишенные MRC1, погибли более быстро из этого состояния.

«Когда мы смотрели на образцы крови у пациентов с сепсисом человека, мы обнаружили, что в белках, которые накапливались, была разница, по сравнению с MRC1 -дефицитом мыши,-сказал Сарасват.-Однако, когда мы сравнили пути, контролируемые этими белками, половина из тех, кто активировался при сепсисе человека, также активировались дисфункцией MRC-1 ».

«Чтобы понять такую роль, что гликозидные связи играют в здоровье и заболеваниях, модифицируя изобилие и активность гликопротеинов крови, нам необходимо расшифровать этот новый язык, охватывающий белок -гликозилирование, обнаружить аномалии и определить, как эта система транслирует в организме, чтобы влиять на различные физиологические функции», – сказал Сарасват.