Дизайн исследования
Базовый обзор этого двунаправленного МР-исследования тяжелой ХБП и COVID-19 показан на рисунке 1. GWAS ХБП включал 43 исследования с общим размером выборки 117 165, включая 12 385 случаев ХБП. Дополнительная таблица 1 содержит подробную информацию обо всех когортах исследования. GWAS с тяжелой формой COIVD19 включали 13 исследований европейского происхождения с общим размером выборки 1 054 664 человека, включая 4792 с тяжелой формой COIVD19. Дополнительная таблица 2 содержит подробную информацию обо всех когортах исследования. Используя сводную статистику GWAS, мы провели два МР-анализа, чтобы изучить связь между ХБП и тяжелым течением COVID-19. В отличие от перспективных МР-исследований, в которых ХБП использовалась в качестве фактора воздействия, а COVID-19 – в качестве исхода, в этом МР-анализе в качестве фактора воздействия использовался тяжелый COVID-19, а в качестве исхода – ХБП. Эта уникальная перспектива дает ценную информацию о потенциальной двунаправленной связи между этими состояниями, способствуя всестороннему пониманию их взаимодействия и информируя о будущих вмешательствах. Основные теории МР показаны на рис. 1. Поскольку это исследование было основано на общедоступной сводной статистике, никакого этического одобрения не требовалось.
рисунок 1
Описание дизайна исследования двунаправленного МР-анализа. (A) Три основных предположения MR-анализа. (B) Прямые МР-анализы показаны красным, при этом ХБП служит фактором воздействия, а тяжелая форма COVID-19 — исходом. Обратные МР-анализы показаны синим цветом: тяжелая форма COVID-19 является фактором воздействия, а ХБП – результатом. LD, неравновесие по сцеплению; ХБП, хроническая болезнь почек; MR — менделевская рандомизация; SNP, однонуклеотидные полиморфизмы
Выбор капельниц для МР-анализа
Для выбора IV, которые лучше всего подходят для MR-анализа, использовались два отдельных объединенных набора данных GWAS. Во-первых, SNP, отвечающие критерию общегеномной значимости (p< 5 × 10 − 8) were chosen. Second, linkage disequilibrium LD was used to shortlist the appropriate SNPs, minimum LD Rsq value set as 0.8, and as determined by r 2 >0,001 в справочной панели европейских 10 000 геномов. Результаты SNP с p < 5 × 10 − 8 затем были исключены. Палиндромные SNP с промежуточными частотами аллелей были исключены при объединении данных о воздействии и результатах, а порог MAF для выравнивания палиндромов составил 0,3. Такой строгий подход обеспечил надежность и точность анализа, позволяя более точно оценить взаимосвязь между интересующими переменными и минимизировать потенциальные искажающие факторы.
Источники данных и выбор внутривенных вливаний для ХБП
В нашем консолидированном метаанализе ХБП были использованы 43 европейские когорты, полученные из CKDgen (наборы данных метаанализа CKDGEN). [uni-freiburg.de]), состоящее из 12 385 случаев и 104 780 контролей (вспомогательная информация, таблица 1) [9]. Четыре независимых генетических IV ХБП были получены в соответствии со следующими 3 критериями: (1) p < 5 × 10-8 было порогом общегеномной значимости; (2) r2 <0,001, что указывает на отсутствие неравновесия по сцеплению между SNP; и (3) отсутствие влияния на другие потенциальные факторы риска. Подробная информация о ВВ представлена в вспомогательной информации, Таблица 3.
Источники данных и выбор внутривенного введения для тяжелого течения COVID-19
Инициатива по генетике хозяев COVID-19 (предоставила нам унифицированные данные метаанализа, которые включали 4792 случая и 1054664 контрольных группы из 14 европейских когорт пациентов с тяжелой формой COVID-19 (вспомогательная информация, таблица 2). [10] Пациенты с тяжелой формой COVID-19, включенные в наше исследование, были госпитализированы либо из-за клинических симптомов, напоминающих лабораторно подтвержденную инфекцию SARS-CoV-2 и требующих респираторной помощи, либо потому, что, к сожалению, они умерли в первую очередь от осложнений, связанных с COVID-19. Эти критерии отбора пациентов обеспечили репрезентативную когорту для изучения последствий и исходов тяжелых случаев COVID-19, что способствовало всестороннему анализу тяжести заболевания и связанных с ним рисков. Если соответствующая информация была доступна, контрольной группой были лица с совпадающим генетическим происхождением, но без подтвержденной инфекции SARS-CoV-2. В этом GWAS было обнаружено семь SNP, связанных с пациентами с тяжелой формой COVID-19, и они были выбраны в качестве внутривенных вливаний. Для проведения обратного МР-анализа мы выбрали подходящие капельницы. Из 7 SNP был удален один SNP с p > 5 × 10−8. Таким образом, в обратный MR-анализ мы в конечном итоге включили 6 SNP в качестве IV (вспомогательная информация, таблица 4).
статистический анализ
Чтобы рассчитать вероятные причинно-следственные связи между тяжелым течением COVID-19 и ХБП, мы использовали метод взвешивания случайных эффектов с обратной дисперсией (IVW). Этот широко признанный статистический подход позволил нам учесть потенциальную гетерогенность и обеспечить надежные оценки причинных эффектов. Модель взвешенной медианной оценки (WME), метод на основе взвешенной модели (WM) и регрессионная модель MR-Egger (MER) также использовались для оценки причинных эффектов. [11,12,13, 15]. Неоднородность между IV была проверена с помощью Q-статистики Кокрейна. Тест на чувствительность с исключением одного использовался для оценки стабильности результатов МР путем исключения IV по одному. [16]. Направленную плейотропию проверяли и корректировали на основе перехвата, полученного в результате анализа MER и теста остаточной суммы и выбросов MR-плейотропии (MR-PRESSO). [17]. Этот двухобразцовый МР-анализ проводился с использованием программного обеспечения R (версия 4.2.0) с пакетами TwoSampleMR (версия 0.5.6) и MR-PRESSO (версия 1.0.0).
2024-01-29 12:05:02
1706530509
#Тяжелая #форма #COVID19 #хроническая #болезнь #почек #двунаправленное #менделевское #рандомизированное #исследование #Вирусологический #журнал