Home » 1000-летний случай синдрома Клайнфельтера, диагностированный путем интеграции морфологии, остеологии и генетики.

1000-летний случай синдрома Клайнфельтера, диагностированный путем интеграции морфологии, остеологии и генетики.

Скелет человека, захороненного более 1000 лет назад в средневековых археологических раскопках Торре-Велья на северо-востоке Португалии, был передан нам для анализа и исследования (приложение).
При осмотре мы обнаружили исключительно хорошо сохранившийся скелет взрослого человека, которому на момент смерти, вероятно, было более 25 лет. Рост человека был приблизительно 1,80 м. Примечательно, что из шести исследованных скелетов, у которых можно было установить рост, этот человек был самым высоким (приложение). На основании морфологии таза и метрического анализа скелета мы пришли к выводу, что это был мужчина. Однако ширина подвздошных костей нашего человека составляла 289 мм, что значительно больше, чем средняя ширина, о которой сообщалось ранее у древних португальцев (в среднем 261,8 мм; SD=13,4; т тест: т=22·6944; дф=124; пфигура; приложение). Анализ костной денситометрии показал нормальные значения минеральной плотности кости (0,792–0,999 г/см3).2).

ФигураДиагностика синдрома Клайнфельтера в 1000-летнем скелете

Показать полную подпись

На фотографиях черепа показаны вид спереди (А) и сбоку (В) с вероятным нарушением прикуса и верхнечелюстным прогнатизмом, на который указывает атипичная стираемость зубов. (C) На графике показана наблюдаемая доля прочтений, сопоставленных с X-хромосомой (ось x) и Y-хромосомой (ось y), окрашенных по кариотипу: XX (красный), XY (синий), XXY (зеленый) и с наибольшей вероятностью загрязнен XXα XY (фиолетовый). Реальные данные указаны кружками; теоретические позиции (для XXY и загрязненных) отмечены крестиками. Многоточие указывает достоверность 50%, 90%, 95%, 99% и 99,9%.

Генетический анализ был проведен с использованием множества различных методологий, включая расчет соотношения аутосом Х-хромосомы к Y-хромосоме (0,902 и 0,298 соответственно), дозировок Х-хромосомы и Y-хромосомы (приблизительно 2 и 1 соответственно) и Гетерозиготность по Х-хромосоме (примерно 0,2). Мы также определили гаплогруппу Y-хромосомы как R1b-P310 (R1b1a1b1a1), частую западноевропейскую и панъевропейскую линию, в соответствии с иберийским генетическим происхождением человека (приложение).
Кроме того, используя новый байесовский метод, позволяющий нам вероятностно назначать индивидуумам кариотипы на основе количества прочтений секвенирования или секвенированных фрагментов ДНК, сопоставленных с X, Y или аутосомными хромосомами, мы пришли к выводу, что кариотип нашего индивидуума равен 47, XXY. , и отвергнутые модели загрязнения XXY и XX или XY (фигура; приложение). Близость наблюдаемого положения изучаемой особи и теоретического положения для кариотипа XXY (фигура) полностью согласуется с нашей апостериорной вероятностью приблизительно 1 для этого человека с кариотипом синдрома Клайнфельтера. Принимая во внимание морфологические данные, в частности высоту, ширину подвздошных костей, возможную аномалию прикуса челюсти и прогнатию верхней челюсти, а также генетические данные, указывающие на кариотип 47, XXY, мы пришли к выводу, что у исследуемого человека был синдром Клайнфельтера.

Ранее сообщалось, что распространенность синдрома Клайнфельтера в общей популяции составляет 0,1–0,2%, но многие пациенты остаются недиагностированными.

Read more:  25 лучших бейсбольных рейтингов средней школы по версии Los Angeles Times

Как правило, люди с синдромом Клайнфельтера имеют высокий рост, широкие бедра, редкие волосы на теле, маленькие яички и гинекомастию; у них может быть нижнечелюстной прогнатизм. Наблюдаются ожирение, низкая толерантность к глюкозе и диабет, а также остеопороз из-за дефицита андрогенов. Примечательно, что отсутствие остеопороза в нашем случае не исключает диагноз синдрома Клайнфельтера; остеопороз присутствует только примерно в 10–40% случаев. Генетически около 80% случаев приходится на 47,XXY.

ДНК из остеологических останков часто бывает скудной, деградированной, фрагментированной и непригодной для анализа с использованием общедоступных методов клинической диагностики хромосомных анеуплоидий. Чтобы преодолеть эти ограничения, мы разработали новый байесовский метод, который, как мы полагаем, является потенциально эффективным статистическим способом анализа фрагментированной ДНК из различных источников (например, древней ДНК, бесклеточной ДНК и ДНК из судебно-медицинских экспертиз). .

Авторы

XR-R и JCT разработали проект. ST, AB и PCC провели археологические раскопки. ST, CU и FC провели морфологический и остеологический анализы. XR-R, MPW, BL и JCT провели эксперименты с древней ДНК. IWD сгенерировал данные секвенирования ДНК. XR-R, YS, BL и JCT проанализировали данные. ABR разработал и применил байесовский метод к генетическим данным. XR-R и JCT написали рукопись при участии всех авторов. Письменного согласия от пациента не получено.

Обмен данными

Генетические данные, представленные в этой клинической картине, будут доступны после публикации.

Декларация интересов

Мы заявляем об отсутствии конкурирующих интересов.

Благодарности

Мы благодарим муниципалитет Брагансы, Университет Коимбры, Университет Аделаиды, Общество Макса Планка и Фонд Калуста Гюльбенкяна за оказанную поддержку. ST поддерживается Fundação para a Ciência ea Tecnologia (SFRH/BD/116363/2016). BL (FT170100448) и JCT (DE210101235) поддерживаются Австралийским исследовательским советом. ABR поддерживается Европейским исследовательским советом (771234-PALEoRIDER).

Read more:  Ученые научились побеждать запах пота с помощью вирусов

Дополнительный материал

Leave a Comment

This site uses Akismet to reduce spam. Learn how your comment data is processed.