Валенсийские ученые выяснили, как узнать, будет ли Helicobacter pylori устойчива к антибиотикам

Используемые в настоящее время методы лечения направлены на уничтожение бактерий во избежание более серьезных осложнений и основаны на сочетании антибиотиков и лекарств для защиты желудка. «Однако методы лечения Helicobacter pylori терпят неудачу примерно в 25 процентах случаев, как правило, из-за бактерий, устойчивых к одному из используемых антибиотиков», — объясняет Иньяки Комас, руководитель исследования, опубликованного в «The Lancet Microbe», и исследователь CSIC в Институте биомедицины Валенсии (IVB). То есть каждый четвертый курс лечения по его искоренению неэффективен, поскольку бактерия стала устойчивой к антибиотикам.

Однако теперь команда Комаса совместно с учеными из Национального справочного центра по кампилобактериям и хеликобактерам (Франция) разработала новый метод, основанный на геномном секвенировании, который точно предсказывает устойчивость Helicobacter pylori к ключевым антибиотикам в лечении, позволяя нам заранее знать, какая терапия будет лучшей для каждого пациента. Лечение по меню для каждого пациента.

Трудно воспроизвести в лабораториях.

Традиционно лабораторным методом определения возможной устойчивости бактерий к определенным лекарствам является бактериальная культура. Этот метод заключается в культивировании бактерий, то есть в обеспечении им оптимальной среды для размножения и, таким образом, в получении бактериальной популяции, достаточно большой для облегчения диагностики. Проблема в случае H. pylori заключается в том, что этот процесс особенно сложен, и результаты нелегко воспроизвести в разных лабораториях.

В этом контексте ответственные за новое исследование разработали метод, который вместо культивирования бактерий использует геномное секвенирование для выявления конкретных мутаций, которые повышают устойчивость к кларитромицину и левофлоксацину, двум антибиотикам, используемым против H. pylori.

«Хотя для получения генома бактерий требуется положительная культура (подтверждение присутствия бактерии в образце), нет необходимости делать дополнительные культуры для выявления устойчивости, что экономит время и ресурсы. Кроме того, этот метод является более точным и воспроизводимым, что позволяет избежать ошибок, связанных с традиционными тестами», — подчеркивает Альваро Чинес, исследователь Фонда содействия здоровью и биомедицинским исследованиям Валенсийского сообщества (Фисабио), а также ведущий автор исследования.

Благодаря этим результатам они создали каталог генетических мутаций, который позволяет диагностировать устойчивость только с помощью анализа, позволяющего узнать ее геном. Более того, они оценили глобальную распространенность этих форм сопротивления, выявив важные различия между регионами мира. Так, в частности, установлено, что в Юго-Восточной Азии к кларитромицину устойчиво до 51,2% штаммов, а к левофлоксацину – менее 13%. Напротив, более половины южноазиатских штаммов были устойчивы к левофлоксацину, но менее пяти процентов были устойчивы к кларитромицину.

Масштабируемое приложение

По мнению исследователей, этот метод обеспечивает глобальное и масштабируемое применение, поскольку его можно интегрировать в платформы геномной диагностики и адаптировать к потребностям каждого региона. «Эту технологию можно использовать в клинической диагностике, чтобы с самого начала выбрать наиболее подходящее лечение», — подчеркивает Комас. По его мнению, постепенное внедрение генетического секвенирования в больницах, особенно после пандемии Covid-19, когда эти типы инструментов стали использоваться чаще, позволило бы интегрировать этот анализ на H. pylori. То есть методы, используемые для обнаружения коронавируса, теперь можно будет адаптировать для исследования ДНК этой желудочной бактерии в каждом конкретном случае.

Кроме того, он добавил, что этот метод полезен для проведения эпидемиологического надзора за устойчивостью к антибиотикам и для разработки новых терапевтических стратегий. В долгосрочной перспективе исследователи уверены, что это может способствовать снижению неудач в лечении и улучшению контроля инфекций Helicobacter pylori во всем мире.