Исследование изучает распространение супербактерии клебсиеллы между людьми и окружающей средой

Международная группа ученых, изучающая передачу смертельной лекарственно-устойчивой бактерии, которая конкурирует с MRSA, обнаружила, что, несмотря на то, что жуки встречаются у домашнего скота, домашних животных и в более широкой окружающей среде, они редко передаются людям этим путем.

Исследователи под руководством профессора Эда Фейла из Центра эволюции Милнера в Университете Бата изучили распространенность клебсиелла, семейство видов бактерий, которые безвредно живут в кишечнике, но могут быть опасны при распространении на другие части тела.

Клебсиелла пневмонии является наиболее известным видом в этом семействе, который может вызывать пневмонию, менингит, инфекции мочевыводящих путей и инфекции в кровотоке.

Эти бактерии в настоящее время обладают высокой устойчивостью к антибиотикам, а некоторые штаммы даже устойчивы к карбапенемам, одному из так называемых антибиотиков «последнего средства», который используется только тогда, когда никакие другие антибиотики не работают.

клебсиелла обогнала MRSA как проблему со здоровьем в Великобритании, причем показатели неуклонно растут. ВОЗ признала бактерии критически важным патогеном, связанным со здравоохранением.

Помимо того, что микроб был обнаружен в больницах, ранее он также обнаруживался в окружающей среде, включая домашний скот и сточные воды, но до сих пор было неясно, передавались ли бактерии между клинической и неклинической средой.

В ходе крупнейшего из когда-либо проводившихся исследований команда собрала 6 548 образцов в течение 15 месяцев из разных мест в итальянском городе Павия и его окрестностях, где этот патоген представляет собой серьезную проблему в больницах, и проанализировала их, используя методы секвенирования всего генома для обнаружения. и определить любой клебсиелла присутствующие бактерии.

Команда брала мазки у пациентов в больницах и здоровых «носителей» в сообществе, брала образцы с ферм, луж, домашних животных и даже домашних мух и других насекомых, чтобы определить, где присутствуют бактерии.

Из них они обнаружили 3482 изолята, включая 15 различных видов клебсиеллапричем половина положительных образцов содержала К. пневмонии.

Когда команда генетически секвенировала бактерии, чтобы определить, какие штаммы присутствуют, они обнаружили, что очень мало совпадений между теми бактериями, которые были обнаружены в больницах, и теми, которые были найдены в окружающей среде.

Профессор Эд Фейл, руководивший исследованием, сказал: “клебсиелла инфекции становятся все более устойчивыми к антибиотикам, поэтому, если раньше вы могли легко лечить большинство инфекций мочевыводящих путей, то теперь все чаще пациенты заражаются инфекциями, которые продолжают возвращаться и вызывать проблемы.

“клебсиелла также может вызывать пневмонию, от которой умирает около половины пациентов. Эти бактерии представляют большую проблему в Великобритании, чем MRSA.

«Наши исследователи хотели выяснить, распространяются ли в настоящее время устойчивые бактерии на домашних животных, фермы, домашний скот, растения и воду, и поэтому мы хотели выяснить, где клебсиелла обнаруживается, и отслеживать, как он распространяется, чтобы информировать о том, как лучше всего предотвратить вспышки и контролировать их.

«Мы обнаружили, что он присутствует повсюду, но были удивлены тем, что штаммы, обнаруженные в больнице, отличались от штаммов, обнаруженных в окружающей среде, что указывает на то, что передача между двумя средами обитания очень незначительна: люди почти всегда заражаются этим от других людей.

«Это подтверждает, что лучшим способом борьбы с инфекцией этих бактерий остается строгая больничная гигиена, и что меньше вероятность того, что вспышки могут быть вызваны контактом с животными или окружающей средой, чем опасались ранее, по крайней мере, в стране с высокими ресурсами, такой как Италия. “

Опасения заключались в том, что фермеры могут получить эти бактерии от своего скота или почвы, что мы можем заразиться зараженным салатом или заболеть, если купаемся в зараженных озерах.

Наши исследования не дали никаких доказательств этого, однако мы обнаружили устойчивые клебсиеллы у домашних животных, таких как кошки и собаки. Ветеринары и владельцы должны знать об этом, так как эти животные могут представлять риск распространения бактерий».

Доктор Гарри Торп, первый автор статьи, Университет Осло (Норвегия)

Консорциум проекта под названием SpARK возглавлял Бат, но в него вошли исследователи из Великобритании (Институт Wellcome Sanger, университеты Бристоля и Глазго), Норвегии, Франции, Финляндии и Италии. Работа финансировалась Совместной программной инициативой по устойчивости к противомикробным препаратам (JPI-AMR) и MRC и опубликована в Природная микробиология.

Профессор Фейл сказал: «Это крупнейшее и наиболее систематическое исследование, которое проводилось одновременно в одном географическом месте.

«Мы изучали передачу штаммов, однако устойчивость к антибиотикам может быть очень легко передана другим штаммам, когда они меняются местами и собирают кольцевые фрагменты ДНК, называемые плазмидами.

«Далее мы хотим проследить, как плазмиды передаются между штаммами, используя технику, называемую секвенированием с длинным чтением».

Команда недавно получила для этого сетевой грант от JPIAMR, который основан на исследовательском сообществе GW4 и поддерживается Альянсом GW4 AMR.