Исследователи нашли 3 новых локуса, чтобы лучше понять генетические факторы апноэ во сне

Лучшее понимание роли генетики в обструктивное апноэ сна (СОАС) может позволить лучше лечить чрезмерную дневную сонливость.¹

Группа под руководством Павитры Награджан из Brigham and Women’s Hospital исследовала ген с помощью анализа взаимодействия сонливости с помощью OSA.

Существует целый ряд симптомов, связанных с СОАС, включая чрезмерную дневную сонливость, которая предположительно представляет собой более тяжелый подтип. Существует значительная наследуемость и прошлые GWAS, но генетические механизмы до сих пор неясны.

Поскольку чрезмерная дневная сонливость отражает хроническую недостаточность сна и провоспалительное состояние, она может взаимодействовать с генетическими вариантами, изменяя риск ОАС.

Данные были представлены во время СОН 2023 Ежегодное собрание в Индианаполисе.

В исследовании ученые использовали данные секвенирования всего генома 11 619 человек разной расы и этнического происхождения. Пациенты были выбраны из программы NHLBI Trans-Omics for Precision Medicine.

Исследователи искали результаты индекса апноэ-гипопноэ (AHI) и шкалы сонливости Эпворта (> 10: EDS, <= 10: не-EDS).

Исследователи использовали пакет GENESIS R для выполнения двухэтапной ранговой нормализации, корректировки по возрасту, полу, индексу массы тела (ИМТ), предковым ПК, когорте и генетическому родству, а также масштабированию остатков до единичной дисперсии отдельно в каждом исследовании или родословной. группа.

Они также использовали программное обеспечение GEM для проведения анализа взаимодействия генов и EDS, включая 1 тест df маргинального эффекта SNP и эффект взаимодействия SNPxEDS на AHI, соответственно, и 2 теста df совместной значимости обоих.

Наконец, они использовали надежные стандартные ошибки с порогом значимости п <5x10-8.

Результаты показывают, что 1 новый локус (rs35370454) был идентифицирован с помощью теста 1 df на маргинальный эффект SNP, который сопоставлен с IFRD1, сверхэкспрессия которого связана с ограничением сна и гипометилированием при нарколепсии.

Они также обнаружили 2 новых локуса (rs13118183, rs281851), которые картированы с генами MARCHF1 и CCDC3 в тесте 1 df эффекта взаимодействия.

Однако тест на 2 df не выявил каких-либо дополнительных новых локусов.

Наконец, было показано, что CCDC3 подавляет воспалительную активность TNF-альфа, цитокина, предположительно участвующего в регуляции сна, а MARCHF1, как было показано, ингибирует клеточную чувствительность к инсулину и способствует NF-KB, при этом степень активации положительно коррелирует с тяжестью ОАС.

«Моделируя эффект модификации EDS на OSA, мы выявили 3 новых локуса», — пишут авторы. «Этот подход может быть полезен для понимания генетических факторов, которые различаются в зависимости от подтипа СОАС. В качестве следующих шагов мы стремимся провести повторный анализ с использованием независимых вмененных выборок».

Павитра Нагараджан и др., 0034 Генетические варианты обструктивного апноэ сна, выявленные после моделирования взаимодействия с дневной сонливостью, СпатьТом 46, Приложение к выпуску_1, май 2023 г., страницы A15–A16, https://doi.org/10.1093/sleep/zsad077.0034