Все началось с некоторых интригующих научных открытий.
Группа исследователей из Института Броуда и Гарварда почти два десятилетия назад начала подозревать, что так называемые «новые болезни», такие как Эбола и вирус Ласса, не совсем то, чем кажутся. Все больше данных свидетельствуют о том, что это были не новые инфекции, а древние патогены, циркулировавшие среди людей на протяжении тысячелетий. Что действительно появилось, так это точная диагностика: медицина лишь недавно получила возможность выявлять эти заболевания и отслеживать потери от вспышек.
Эти откровения посеяли семена для Стражсеть наблюдения за заболеваниями. В прошлом месяце Фонд Макартуров объявил о награде Sentinel в размере 100 миллионов долларов — финансирование поступило как раз в тот момент, когда организация столкнулась с возможностью закрытия после серьезного сокращения федеральной поддержки.
«Работа в области обеспечения готовности к пандемиям и глобального здравоохранения сейчас переживает экзистенциальный кризис из-за сокращения федерального финансирования», — сказал соучредитель Sentinel. Пардис Сабетипрофессор организмической и эволюционной биологии и профессор иммунологии и инфекционных заболеваний в Институте Броуда Массачусетского технологического института и Гарварда. “Мы действительно оказались на опасном выступе. Так что это полностью все изменило”.
Происхождение
В детстве Сабети любил математические головоломки. Когда ей было два года, ее обучала дома старшая сестра после того, как ее семья бежала из Ирана и переселилась во Флориду. Еще в дошкольном возрасте она начала изучать математику. К тому времени, когда она пошла в школу, она уже знала материал, поэтому сосредоточилась на том, чтобы сделать его быстрее, чем все остальные — стремление к совершенству, которое никогда не прекращалось. Когда она была студенткой Массачусетского технологического института, ее научный руководитель Эрик Ландер помог ей увидеть генетику как математический код жизни. Она выиграла стипендию Родса, получила степень доктора философии. из Оксфорда, а также степень доктора медицины из Гарвардской медицинской школы.
В первые годы тысячелетия она разработала методы поиска сигналов естественного отбора во вновь созданных базах данных геномов человека популяций по всему миру. Ее самое яркое открытие показало, что у народа йоруба в Нигерии есть мощный признак отбора в гене под названием LARGE. Позже она узнала, что на этот ген нацелен вирус Ласса, который впервые был обнаружен в Нигерии. Это открытие позволило предположить, что вирус лихорадки Ласса циркулировал в течение тысяч лет, и люди в пострадавших районах подверглись естественному отбору, чтобы противостоять ему.
За советом она обратилась к Кристиан Хаппиколлега, имевший опыт работы в том же регионе.
Выполнение обещания
Выросший в Африке, Хаппи перенес несколько приступов малярии, один из самых тяжелых случился, когда ему было около 8 лет. Мать отвезла его в местную больницу, где ему сделали укол хинина. По дороге домой они отдыхали под тенистым деревом, и Хаппи спросил мать, почему никто не изобрел лекарство от этой болезни. «Следующее, что я ей сказал, было: «Мама, когда я вырасту, я найду лекарство от этого», — вспоминает он. «Это действительно то, что меня двигало».
Хаппи получил степень бакалавра биохимии в Университете Яунде в Камеруне и степень доктора философии. из Университета Ибадана в Нигерии. В 2000 году он приехал в Гарвард в качестве постдокторанта в лабораторию эксперта по тропическим болезням профессора. Дайанн Вирт в Школе общественного здравоохранения. Он стал научным сотрудником кафедры иммунологии и инфекционных болезней, а после возвращения в Нигерию — приглашенным ученым. Он изучал малярию в штате Эдо в Нигерии, который также оказался очагом лихорадки Ласса.
Когда Сабети рассказала ему о своих удивительных открытиях, они начали обсуждать, как проводить дальнейшие расследования.
«Прежде чем мы узнали об этом, мы создали полевой участок в сельской местности Нигерии для изучения вируса лихорадки Ласса», — сказал Сабети. “Он просто движется как ветер. Он не упускает возможности пройти мимо себя”.
Древние болезни, современные методы
Они столкнулись с суровой реальностью на местах. Хаппи, посетивший сельскую больницу в эпицентре вспышки лихорадки Ласса, был потрясен, обнаружив отсутствие диагностической инфраструктуры. Работник больницы показал ему холодильник, полный флаконов, и объяснил, что лихорадку Ласса диагностируют по цвету образцов плазмы.
Команда разработала молекулярный диагностический тест на вирус Ласса, применила его в том же сельском сообществе в 2008 году и обучила местный персонал проведению тестов.
«Внедрение этого теста фактически изменило парадигму в этом сообществе», — сказал Хаппи. “Поскольку они смогли диагностировать людей раньше, они смогли спасти больше жизней. Уровень смертности снизился с 90 процентов до 23,6 процента”.
В 2013 году Хаппи и Сабети выиграли грант Всемирного банка на создание Африканского центра передового опыта в области геномики инфекционных заболеваний при Университете Искупителя в Эде, Нигерия. Вскоре после этого разразилась эпидемия Эболы.
В Сьерра-Леоне команда диагностировала первый случай Эболы в стране. Образцы были срочно доставлены в Институт Броуда, где исследователи секвенировали 99 геномов вируса Эбола, что помогло выяснить, как распространяется болезнь. В Нигерии Хаппи диагностировал первый случай и возглавил национальные ответные меры. Нигерия мобилизовала агрессивную кампанию общественного здравоохранения, которая включала широкое отслеживание контактов, более 18 000 личных посещений и широкую работу с населением.
«Нигерия успешно сдержала Эболу», — сказал Хаппи. “За 62 дня все закончилось, и было всего 20 случаев заболевания и восемь смертей, и это в стране с населением 230 миллионов человек. Это была первая демонстрация того, что если развернуть такую систему, как Sentinel, она работает. И мы повторяли это снова и снова”.
Основываясь на этих уроках, Сабети и Хаппи стремились создать постоянную систему наблюдения за болезнями и реагирования на них. Они предполагали создать сеть экспертов и центров диагностики и генетического секвенирования в Западной Африке, которые могли бы быстро выявлять инфекционные заболевания до того, как они перерастут в более крупные вспышки или полномасштабные пандемии.
В начале 2020 года команда под руководством Хаппи и Сабети запустила Sentinel — как раз тогда, когда COVID-19 был объявлен глобальной пандемией. За последние пять лет Sentinel обучила около 3000 медицинских работников почти из каждой африканской страны, провела более 300 000 диагностических тестов и секвенировала около 17 800 образцов вируса. Собранные данные помогли определить ответные меры общественного здравоохранения и сдержать местные эпидемии в Западной и Центральной Африке.
Sentinel разработала ряд диагностических инструментов, таких как недорогие бумажные полоски, которые могут обнаруживать определенные вирусы в полевых условиях, и лабораторные тесты в больницах, которые могут одновременно выявлять сотни заболеваний. Компания также разработала облачную информационную платформу, которая позволила медицинским работникам обмениваться информацией и координировать реагирование в режиме реального времени.
Новая угроза исходит не от патогенов, а от политики. Организация потеряла миллионы долларов в виде грантов от правительственных учреждений, включая Центры по контролю и профилактике заболеваний, Национальные институты здравоохранения и Агентство США по международному развитию.
Sentinel сократила штат и столкнулась с неопределенным будущим.
«Это было буквально: будем ли мы существовать или не будем?» – сказал Сабети. “Мы потеряли большую часть нашего федерального финансирования, и перспективы нового федерального финансирования были мрачными. Мы столкнулись с экзистенциальным обрывом”.
Затем последовал спасительный укол. В ноябре Фонд Джона Д. и Кэтрин Т. Макартуров награжден 100 миллионами долларов в проект Sentinel, что позволит организации не только выжить, но и расширить свою деятельность. Уже созданная в Нигерии и Сьерра-Леоне, она теперь распространится на Сенегал, Руанду и Демократическую Республику Конго.
«Если вы посмотрите на масштабы работы, которую необходимо проделать, вы поймете, что в конечном итоге 100 миллионов долларов — это не такие уж большие деньги», — сказал Хаппи. «Но ее можно использовать, чтобы направить ситуацию в правильном направлении, используя эту работу, чтобы продемонстрировать, что возможно на континенте, и это действительно может спровоцировать более широкое движение».
По теме
