Геном шерстистого носорога извлечен из мяса в замороженном желудке волчонка

Геном, реконструированный из крошечного кусочка плоти, найденного в желудке волчонка, умершего 14 400 лет назад, позволяет предположить, что шерстистые носороги все еще были генетически здоровы, даже когда им грозило неминуемое вымирание.

Никто никогда не узнает, как молодая волчонка умерла недалеко от нынешнего города Тумат на севере Сибири, Россия. Но наиболее вероятно, что она и ее сестра, вместе известные как Щенки насыпитолько что накормили мясом шерстистого носорога (Целодонта древности) их матерью, когда их логово рухнуло, захоронение братьев и сестер в вечной мерзлоте в течение 14 400 лет.

Первого щенка нашли на месте в 2011 году, второго — в 2015 году. При вскрытии содержимого желудка одного из щенков был обнаружен кусок мяса шерстистого носорога.

Эдана Лорд Член команды, изучавшей этот фрагмент из Стокгольмского университета в Швеции, говорит, что он выглядел «очень похоже на кусок вяленого мяса с небольшим количеством пуха».

«На нем все еще были волосы, что было довольно необычно», — говорит Лорд.

Она говорит, что фрагмент сохранился благодаря почти чудесной и исчезающе редкой серии совпадений.

«Для нас, много, много, много тысяч лет спустя, обнаружить этих прекрасно сохранившихся мумифицированных волчат, изучить содержимое их желудков и обнаружить этот кусок ткани шерстистого носорога, который затем пролил свет на совершенно другой вид, — это очень уникально и круто», — говорит Лорд.

По этому фрагменту Лорд и ее коллеги смогли реконструировать геном шерстистого носорога и определить, что это была самка без признаков инбридинга в ДНК.

По ее словам, это открытие очень важно, поскольку этот вид вымер всего несколько столетий спустя, и это первый случай, когда ученые восстановили генетический материал шерстистого носорога так близко к дате его исчезновения.

Уже давно обсуждается, что привело к исчезновению шерстистого носорога – давление со стороны человека, связанное с охотой, изменение климата или просто то, что инбридинг привел к тому, что этот вид больше не процветал.

Еще один член команды, Любовь Далентакже из Стокгольмского университета, говорит, что, поскольку мех на фрагменте был желтоватого цвета, до тех пор, пока не была проведена работа по ДНК, считалось, что это останки пещерного льва (Пантера спелея).

«Насколько мне известно, секвенирование всего древнего генома из образца содержимого желудка никогда раньше не проводилось», — говорит Дален.

Он говорит, что команда сравнила этот новый геном с двумя другими геномами шерстистого носорога — одному из них около 18 000 лет, а другому — не менее 49 000 лет — и не обнаружило никаких изменений в генетическом разнообразии или уровнях инбридинга с течением времени.

«Если бы произошло сокращение популяции, мы бы увидели меньшее разнообразие и более высокий уровень инбридинга у «желудочного носорога», — говорит Дален.

Вместо этого, по мнению команды, наиболее вероятной причиной вымирания стал быстрый период потепления климата между 14 700 и 12 900 лет назад, называемый интерстадиалом Бёллинг-Аллерёд, который мог привести к драматическим изменениям в среде обитания шерстистого носорога.