Подробный взгляд на архитектуру хроматина

Организация и архитектура хроматина играют решающую роль в регуляции транскрипции, управляя экспрессией генов посредством взаимодействия цис-регуляторные элементы. Картирование этих контактов на уровне отдельных мотивов, связывающих транскрипционные факторы, остается сложной задачей. Ли и др. разработали мелкомасштабный метод, который позволяет с помощью разрешения пар оснований идентифицировать новые принципы цис-регуляторно-опосредованное взаимодействие. Авторы разрешают контакты между отдельными мотивами транскрипционных … Read more

Организация хроматина, связанная с механизмом подавления опухолей p53

Обложка, показывающая нуклеосому, связанную различными кофакторами и P53. Кредит: Колби Р. Сандат (EPFL) Каждая клетка в наших телах несет около двух метров ДНК в своем ядре, упакованных в крошечный объем всего несколько сотен кубических микрометров – около миллиона миллилитра. Клетка управляет этим, обливая струны ДНК вокруг белковых катушек. Комплексы белка-ДНК называются нуклеосом, и они гарантируют, … Read more

Коррекция автора: капель HI-C позволяет масштабируемому одноклеточному профилированию архитектуры хроматина в гетерогенных тканях

Эти авторы внесли одинаково: Лей Чанг, Ян Се. Кафедра клеточной и молекулярной медицины, Калифорнийский университет, Сан -Диего, Ла -Холла, Калифорния, США. Лей Чанг, Бретт Тейлор, Чжаон Энг Дж. Арманд, JEI Программа выпускников биомедицинских наук, Калифорнийский университет, Сан -Диего, Ла -Холла, Калифорния, США. Ян Се и Бретт Тейлор Программа обучения ученых -медиков, Калифорнийский университет, Сан -Диего, … Read more

Крио-Эм раскрывает прекрасные структурные детали ремоделера хроматина человека в действии

Реконструирование хроматина играет жизненно важную роль в регуляции генов, влияя на доступ к ДНК. Разрушения в этом процессе также могут привести к раку и другим заболеваниям. Чтобы лучше понять, как работает ремоделирование хроматина, ученые в Детской исследовательской больнице Св. Иуды использовали криоэлектронную микроскопию (крио-ЭМ), чтобы получить прекрасные структурные детали ремоделера хроматина человека в действии. Исследователи … Read more

Модель на основе хроматина для расшифровки взаимодействия генов

Основные модели использовали различные профили экспрессии генов для таких задач, как аннотация типа клеток или прогнозирование ответа на возмущение. Тем не менее, пока не существует модели, чтобы продемонстрировать, как ландшафт хроматина регулирует транскрипцию. Написание в ПриродаLu et al. Введите общий трансформатор экспрессии (GET), основанную модель, обученную данным доступности хроматина от различных типов клеток человека, и … Read more