Однажды в пещере к северу от Дуранго, Мексика, кто-то испражнялся. На самом деле, их было довольно много, и события эти были растянуты на довольно большой промежуток времени — примерно с 725 по 920 год нашей эры. исследователи теперь полагают. Благодаря засушливым условиям пещеры, когда археологи проводили здесь раскопки в 1950-х годах, экскременты находились в довольно хорошей форме. Выветрившиеся, сухие и наполненные клетчаткой, эти образцы стула дали ученым ценную информацию о том, какой пищей питались люди в давние времена и что жило в их кишках.
[time-brightcove not-tgx=”true”]
Отложения из пещеры сейчас активно путешествуют, попав в различные лаборатории, заинтересованные в их изучении. В 2021 году одна глобальная команда сотрудников проанализировали ДНК, содержащуюся в старых фекалиях— или палеофекалии, как это тонко называют, — чтобы посмотреть, смогут ли они идентифицировать микробы в микробиомах кишечника какашек.
Теперь, в новый документ опубликовано в ПЛОС ОдинДругая группа исследователей по-новому взглянула на ДНК, взятую из 10 фекалий. Их результаты во многом подтверждают более раннее открытие: люди, которые делали эти какашки, были хозяевами зверинца паразитов.
Играя роль хозяина для червей
Обычно фекалии, с которыми работает Дрю Капоне, ведущий автор исследования, гораздо более свежие. Микробиолог-эколог из Университета Индианы, Капоне изучает, как санитария влияет на здоровье. “Наша работа направлена на вопрос: “Как фекалии попадают в окружающую среду? Где находятся фекалии в окружающей среде? Как инфраструктура предотвращает попадание фекалий в окружающую среду? И затем, как фекалии влияют на здоровье детей?””, – говорит он.
Капоне и его коллеги были заинтересованы в использовании методов обнаружения патогенов в современных фекалиях на древних фекалиях. Эти методы сортируют ДНК в образце в поисках определенных генов, которые являются признаками паразитов, таких как острицы, а также бактериальных патогенов.
Читать далее: Возможно, прямо сейчас в вас находится паразит. Вот как сказать
Чтобы извлечь эту ДНК, исследователям пришлось получить образцы палеофекалий из пещеры. Это оказалось сложнее, чем они ожидали: “Нам пришлось измельчить эти древние фекалии в порошок. Мы не могли толком отломить кусочки”, – говорит Капоне. Они выполнили процедуру поиска совпадений ДНК и получили результаты, свидетельствующие о том, что в фекалиях находился ряд различных патогенов, в том числе острицы, простейшие паразиты лямблии и различные патогенные бактерии.
Многие фекалии оказались положительными на несколько организмов. По опыту Капоне, такое большое количество болезнетворных микроорганизмов не является чем-то необычным в местах с плохими санитарными условиями, что заставляет его подозревать, что люди, которые сбрасывали эти фекалии много веков назад, находились в аналогичной ситуации.
Почему выбор техники имеет значение
Однако есть причины, по которым большинство лабораторий, работающих с древней ДНК, больше не используют эти процедуры, говорят Кирстен Бос и Александр Хубенер, специалисты по древней ДНК из Института эволюционной антропологии Макса Планка. ДНК имеет тенденцию разваливаться с течением времени, изнашиваясь и фрагментируясь. Более старая техника, используемая в ПЛОС ОДИН бумага предпочитает более длинные участки ДНКа это означает, что трудно быть уверенным, что то, что вы видите, на самом деле является древней ДНК, а не современной ДНК, которая проникла туда случайно. В лабораториях, специализирующихся на изучении древней ДНК, имеются высокотехнологичные чистые помещения, позволяющие свести к минимуму загрязнение. Они также используют секвенирование нового поколения, оптимизированное для такого хрупкого вещества.
Кроме того, большинство лабораторий проверяют концы фрагментов ДНК, где наблюдаются характерные потертости, чтобы подтвердить, что то, на что они смотрят, действительно старое. С помощью техники в ПЛОС ОДИН В статье «вы не можете легко сказать, произошли ли эти химические модификации, которые происходят в древней ДНК», — говорит Бос.
Читать далее: 5 гастроэнтерологов об 1 вещи, которую нужно делать каждый день
Капоне утверждает, что многие из протестированных организмов не способны долго жить вне человеческого кишечника, поэтому риск получить ложноположительный результат от современной ДНК, собранной во время путешествий с фекалиями, может быть довольно небольшим. Кроме того, специализированные лабораторные исследования древней ДНК могут быть дорогостоящими, а этот старый метод более доступен.
Хубенер, который был частью команды, работавшей над исследованием образцов фекалий из пещеры в 2021 году, говорит, что он скептически относится к совпадениям с бактериями — их может быть особенно сложно идентифицировать в древних образцах с помощью этого метода. Однако, учитывая то, что обнаружила его команда, и то, что мы знаем о биологии паразитов, он говорит, что результаты исследований более крупных паразитов, таких как черви, находятся на несколько более прочной основе. «Для меня это правдоподобно», — говорит Хубенер.
«Что было бы особенно интересно, так это использовать как старые, так и новые методы на одних и тех же образцах», — говорит Бос. Это прояснило бы, что старые методы могут надежно обнаружить, что также обнаруживается в новых, самых строгих процедурах.
«Это был бы действительно хороший способ продвинуться вперед», — говорит она.
2025-10-24 11:00:00
1761379930
#Что #древние #фекалии #могут #рассказать #наших #предках
Ещё по этой теме
